金蓮寺は、広島県尾道市因島の曹洞宗寺院。因島水軍城のふもとにあり、中世、瀬戸内で活躍した「村上水軍」の菩提寺である。

境内の墓所には村上家やその家臣の石塔、また明治維新の元勲・鴻雪爪（おおとりせっそう）の墓もある。また因島八十八ヶ所霊場第11番札所「藤井寺」がある。